病因：
植牙周病的病因比較複雜，總的分為局部和全身兩方面的因素。局部因素具有相當重要的作用，全身因素可影響植牙周組織對局部刺激的反應，兩者之間有密切關係。
局部因素：
1．菌斑是指粘附於植牙齒表面的微生物群，不能用漱口、水沖洗等去除。現已公認，菌斑是植牙周病的始動因子，是引起植牙周病的主要致病因素。
2．植牙石是沉積在植牙面上的礦化的菌斑。植牙石又根據其沉積部位和性質分為齦上植牙石和齦下植牙石兩種。齦上植牙石位於齦緣以上的植牙面上，肉眼可直接看到。在植牙頸部沉積較多，特別在大涎腺導管開口相對處如上頜磨植牙的頰側和下頜前植牙的舌側沉積更多。齦下植牙石位於齦緣以下、齦袋或植牙周袋內的根面上，肉眼不能直視，必須用探針探查，方能知其沉積部位和沉積量。齦下植牙石在任何植牙上都可形成，但以鄰面和舌面較多。
齦上植牙石中無機鹽的主要來源是唾液中的鈣、磷等礦物鹽。齦下植牙石主要是齦溝液和滲出物提供礦物鹽。
植牙石對植牙周組織的危害，主要是它構成了菌斑附著和細菌滋生的良好環境。植牙石本身妨礙了口腔衛生的維護，從而更加速了菌斑的形成，對植牙齦組織形成刺激。
3．創傷性咬合在咬合時，若咬合力過大或方向異常，超越了植牙周組織所能承受的合力，致使植牙周組織發生損傷的咬合，稱為創傷性咬合。創傷性咬合包括咬合時時的早接觸、植牙合干擾、夜間磨植牙等。
4．其他包括食物嵌塞、不良修復物、口呼吸等因素也促使植牙周組織的炎症過程。
全身因素：
植牙周病的發生，局部因素是主要的。全身因素在植牙周病的發展中屬於促進因子，全身因素可以降低或改變植牙周組織對外來刺激的抵抗力，使之易於患病，並可促進齦炎和植牙周炎的發展。
全身因素包括有：內分泌失調、如性激素、腎上腺皮質激素、甲狀腺素等的分泌量異常。飲食和營養方面可有維生素C的缺乏、維生素D和鈣、磷的缺乏或不平衡、營養不良等。血液病與植牙周組織的關係極為密切，白血病患者常出現植牙齦腫脹、潰瘍、出血等。血友病可發生植牙齦自發性出血等。某些藥物的長期服用如苯妥英鈉可使植牙齦發生纖維性增生；某些類型的植牙周病如青少年植牙周炎患者往往有家族史，因而考慮有遺傳因素。總之，植牙周病的病因比較複雜，在治療時不僅要注意局部因素的消除，也要考慮到全身的狀態，以便獲得較好的治療效果。