植牙痛是有多種原因造成的，植牙髓炎是疼痛的最常見原因，還有一些其它非齲性疾病也可導致植牙痛。
當齲齒（蛀植牙）發展到一定的深度，達到植牙髓或接近植牙髓時，齲洞內的細菌就可以直接或通過植牙本質的小管而進入到植牙髓腔內，引起植牙髓炎。植牙髓炎引起的植牙痛是極難忍受的，在外界沒有刺激的情況下，也可產生劇烈的自發性疼痛，疼痛為間歇性。多數患者在晚上睡眠時疼痛更重，這是因為臥位比站立時頭處於更低的位置，植牙髓腔內更易充血，從而使髓腔內的壓力升高而壓迫神經，所以疼痛更重。冷熱刺激可使植牙痛加重。患植牙髓炎時疼痛常沿三叉神經分佈區放射到同側的上下植牙和頭面部，所以患者常有半側頭痛、太陽穴痛的症狀。由於植牙髓內神經末梢只有痛覺感受器而沒有定位感受器，所以患者往往分辯不清哪個是病植牙，有時上植牙痛卻感覺是下植牙痛。如果齲齒發展為植牙髓炎，這時疼痛更加激烈，呈跳痛，熱刺激可以使其加重，而冷的刺激可以緩解疼痛，這種病人往往喜歡含一口冷水。再發展到根尖炎時，病人感覺植牙長高了，不敢用病植牙咬東西。 植牙周病
植牙周病可引起兩種不同性質的植牙痛。最常見的是咀嚼痛。由於植牙周組織的炎症，植牙周袋內化膿，而使患者咬東西時非常疼痛。另一種疼痛與齲齒引起的植牙髓炎相似。主要是因為當植牙齒非常鬆動時，細菌由植牙周袋到達植牙根末端的根端孔，再經根端孔進入植牙髓腔內引起植牙髓炎而疼痛。 楔狀缺損和磨耗
老年人因為植牙齒己經用了幾十年，植牙齒咬植牙合面的磨耗和植牙頸部的缺損都相當嚴重，當植牙植牙合面的磨耗和頸部的缺損接近或達到植牙髓時，口內的細菌就可以進入植牙組織而引起植牙髓炎、根尖炎，甚至頜面軟件組織發炎腫脹，從而引起疼痛。